Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sort1Q6PHU5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sort1Q6PHU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sort1Q6PHU5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sort1Q6PHU5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms