Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc82Q6PG04 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms