Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gramd2bQ6PEM6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gramd2bQ6PEM6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms