Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Bhlhb9Q6PB60 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Bhlhb9Q6PB60 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms