Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc148Q6P5U8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc148Q6P5U8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc148Q6P5U8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms