Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nwd2Q6P5U7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nwd2Q6P5U7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms