Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slx4Q6P1D7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slx4Q6P1D7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slx4Q6P1D7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slx4Q6P1D7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms