Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms