Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scaf8Q6DID3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scaf8Q6DID3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scaf8Q6DID3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms