Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms