Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Surf4Q64310 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms