Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col4a5Q63ZW6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col4a5Q63ZW6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms