Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou4f3Q63955 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pou4f3Q63955 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms