Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sin3bQ62141 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sin3bQ62141 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms