Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itga7Q61738 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itga7Q61738 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms