Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Foxf1Q61080 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxf1Q61080 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Foxf1Q61080 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms