Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Neurod1Q60867 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Neurod1Q60867 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms