Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HellsQ60848 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HellsQ60848 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HellsQ60848 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HellsQ60848 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HellsQ60848 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HellsQ60848 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms