Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klf4Q60793 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klf4Q60793 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms