Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sik1Q60670 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sik1Q60670 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms