Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf123Q5XPI3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf123Q5XPI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms