Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ssh2Q5SW75 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ssh2Q5SW75 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ssh2Q5SW75 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms