Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim58Q5NCC9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim58Q5NCC9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms