Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttf2Q5NC05 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms