Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sdr39u1Q5M8N4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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