Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrig2Q52KR2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms