Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx49Q4FZF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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