Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldlrad2Q3V0V0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms