Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Garnl3Q3V0G7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms