Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc27Q3V036 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms