Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc38a11Q3USY0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms