Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rtl4Q3URY0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl4Q3URY0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms