Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms