Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nhlrc4Q3UP44 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nhlrc4Q3UP44 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms