Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ell2Q3UKU1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ell2Q3UKU1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms