Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sf3b2Q3UJB0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms