Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf224Q3UIW8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf224Q3UIW8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf224Q3UIW8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms