Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klhl21Q3U410 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl21Q3U410 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms