Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorlQ3U285 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorlQ3U285 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms