Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTL0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms