Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtf3c3Q3TMP1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms