Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trpm1Q2TV84 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm1Q2TV84 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms