Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chrna5Q2MKA5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms