Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli2Q0VGT2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms