Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms