Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Slc7a1Q09143 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc7a1Q09143 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms