Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HgfQ08048 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HgfQ08048 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms