Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Kcnb1Q03717 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kcnb1Q03717 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms