Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff2Q03404 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms