Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PrkczQ02956 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PrkczQ02956 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PrkczQ02956 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkczQ02956 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PrkczQ02956 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms